Software libre

Python

• Tutorial de python en español
• Numpy en español: paquete fundamental que implementa vectores y matrices.
• matplotlib: gráficas y visualización.
• scipy: algoritmos para la computación científica.
• scikit-learn: machine learning de toda la vida en Python.
• pytorch: redes neuronales, fundamental para generative AI.
• mkdocs: escribir documentación en Markdown.
• sphinx: paquete para escribir documentación y sitios web estáticos en Python.

Visualización

• Paraview: visualización y procesado de datos en 3D.
• mayavi: visualización y procesado de datos en 3D usando Python.
• Vesta: visualización de estructuras cristalinas en 3D.
• VMD: visualización de moléculas y proteínas.

Simulaciones y modelos

• LAMMPS: Programa de molecular dynamics (dinámica molecular) desarrollado en Los Alamos National Laboratory.
• OpenFOAM: Ecuaciones diferenciales en derivadas parciales usando el método de volúmenes finitos (finite volume method), incluyendo las ecuaciones de Navier-Stokes.
• Fenics: Ecuaciones diferenciales en derivadas parciales usando el método de elementos finitos.
• cantera: reacciones químicas y modelos termodinámicos.
• meep: simulación de electromagnetismo usando finite difference time domain methods.